ब्रिटिश जर्नल ऑफ रिसर्च खुला एक्सेस

अमूर्त

अपनी प्रयोगशाला में डे नोवो असेंबली: स्वयंसेवी कंप्यूटिंग का उपयोग करके वर्चुअल सुपरकंप्यूटर

वी उदय कुमार रेड्डी, राजश्री शेट्टर और विद्या निरंजन

क्लाउड और ग्रिड कंप्यूटिंग जैसी नई कंप्यूटिंग तकनीकों के आविष्कार ने इष्टतम संसाधन साझाकरण द्वारा गणना की लागत को कम कर दिया है। फिर भी, कई अनुप्रयोग इन नई तकनीकों में पूरी तरह से स्थानांतरित नहीं हुए हैं, मुख्य रूप से सुरक्षा कारणों से इंटरनेट पर डेटा साझा करने के लिए वैज्ञानिकों की अनिच्छा के कारण। भले ही हार्डवेयर की लागत में भारी कमी आई है, लेकिन कुछ अनुप्रयोगों को विशाल वैज्ञानिक डेटा को संसाधित या विश्लेषण करने के लिए उच्च प्रसंस्करण शक्ति की आवश्यकता होती है। साथ ही कंप्यूट संसाधनों को प्राप्त करने के लिए आवश्यक उच्च लागत के कारण कई वैज्ञानिक अनुप्रयोग अभी भी पूरी तरह से साकार नहीं हुए हैं। ऐसा ही एक अनुप्रयोग अगली पीढ़ी की अनुक्रमण (NGS) है जिसे जीनोम डेटा के टेराबाइट्स से निपटना होगा, जिसके लिए उच्च संगणन शक्ति की आवश्यकता होगी। इसलिए डेटा को कुशलतापूर्वक संसाधित करने के लिए एक सुपर कंप्यूटर की आवश्यकता है।

इस शोधपत्र में, मास्टर और वालंटियर प्रतिमान में डेस्कटॉप मशीनों के एक समूह का उपयोग करके डे नोवो असेंबली को सक्षम करने के लिए बर्कले ओपन इंफ्रास्ट्रक्चर फॉर नेटवर्क कंप्यूटिंग (BOINC) ओपन सोर्स ग्रिड मिडलवेयर का उपयोग प्रस्तावित किया गया है। प्रतिमान को सामान्य कंप्यूटर प्रयोगशालाओं में स्थापित किया जा सकता है जो इंटरनेट पर क्लाउड और ग्रिड कंप्यूटिंग विधियों का उपयोग करने की बैंडविड्थ और सुरक्षा चिंताओं दोनों को समाप्त करता है। यह प्रतिमान डेटा को संसाधित करने के लिए प्रयोगशालाओं में एक आभासी सुपर कंप्यूटर बनाता है।