बायोमेडिसिन में अंतर्दृष्टि खुला एक्सेस

अमूर्त

XNA तकनीक का उपयोग करके कोलोरेक्टल कैंसर का शीघ्र पता लगाना

माइकल जे पॉवेल

डायकार्टा के वैज्ञानिकों ने ट्यूमर जीन उत्परिवर्तन और लिक्विड बायोप्सी और FFPE नमूनों में अन्य महत्वपूर्ण जीन उत्परिवर्तन के लिए संवेदनशीलता की जरूरतों को संबोधित करने के लिए एक अभिनव ज़ेनोन्यूक्लिक एसिड आणविक क्लैंप तकनीक या XNA तकनीक विकसित की है। XNA तकनीक मालिकाना डिज़ाइन किए गए XNA ऑलिगोमर्स का उपयोग संशोधित बैकबोन के साथ करती है जो वाटसन-क्रिक बेस पेयरिंग द्वारा रुचि के लक्ष्य DNA अनुक्रमों को हाइब्रिड करते हैं। जब अनुक्रम पूरी तरह से मेल खाता है, तो XNAs DNA लक्ष्य अनुक्रमों के साथ कसकर हाइब्रिड होते हैं, PCR प्रतिक्रिया में DNA पॉलीमरेज़ द्वारा स्ट्रैंड बढ़ाव को रोकते हैं। हालाँकि, जब लक्ष्य अनुक्रम में उत्परिवर्तन मौजूद होता है, तो बेमेल XNA ऑलिगोमर: DNA डुप्लेक्स की अस्थिरता की ओर ले जाता है, जिससे DNA पॉलीमरेज़ द्वारा स्ट्रैंड बढ़ाव की अनुमति मिलती है। परिणामस्वरूप, केवल उत्परिवर्तन युक्त लक्ष्य अनुक्रम को प्रवर्धन के लिए चुना जाता है और वाइल्ड-टाइप अनुक्रम, बहुत बड़ी मात्रा में DNA/प्रतियों में मौजूद होने के बावजूद, प्रवर्धित नहीं किया जाएगा। चूँकि XNA ऑलिगोमर्स को DNA पॉलीमरेज़ द्वारा पहचाना नहीं जाता है, इसलिए वे बाद की वास्तविक समय PCR प्रतिक्रियाओं में प्राइमर के रूप में काम नहीं कर सकते हैं। XNA आणविक क्लैंप परख तरल बायोप्सी या ट्यूमर ऊतक बायोप्सी (FFPE) नमूनों से प्राप्त न्यूक्लिक एसिड का उपयोग करके अत्यधिक संवेदनशील हैं। 5 एनजी सीटीडीएनए में पता लगाने की सीमा (एलओडी) 0.5% (उत्परिवर्ती डीएनए की 7 या 8 प्रतियां) तक पहुंच सकती है, जो एक मरीज के रक्त के लगभग 2 मिलीलीटर के बराबर है। चूंकि परिसंचारी कोशिका मुक्त उत्परिवर्ती ट्यूमर डीएनए (सीटीडीएनए) और एक्सोसोम व्युत्पन्न न्यूक्लिक एसिड के उच्च स्तर की उपस्थिति को कोलोरेक्टल और अन्य कैंसर में खराब अस्तित्व से जुड़ी हुई पाई गई है और स्तर की गतिशील निगरानी का उपयोग कैंसर के उपचार के लिए एक पूर्वानुमान कारक के रूप में किया जा सकता है।