मुहम्मद आसिफ रशीद
एपोई4 अल्जाइमर रोग के विकास की घटनाओं में वृद्धि के कारण एक प्रमुख आनुवंशिक जोखिम कारक है। अध्ययन ऐसे यौगिकों की भविष्यवाणी करने के लिए डिज़ाइन किया गया था जो एपोई4 प्रोटीन की अधिक गतिविधि को दबाने के लिए दवा को डिजाइन करने में सहायक हो सकते हैं। 22 प्राकृतिक यौगिकों (समुद्री, सूक्ष्मजीव और पौधे व्युत्पन्न) को अवरोधकों के रूप में इस्तेमाल किया गया और एपोई4 (पीडीबी आईडी 1बी68) के साथ डॉक किया गया। 6 सिंथेटिक यौगिकों (नैदानिक परीक्षणों में) को प्राकृतिक यौगिकों के साथ डॉकिंग परिणामों की तुलना और विश्लेषण करने के लिए लक्ष्य प्रोटीन के साथ डॉक किया गया था। यौगिक एस-एलिल-एल-सिस्टीन, एपिकैटेचिन गैलेट और फुल्विक एसिड उच्च बंधन आत्मीयता दिखाते हैं यानी क्रमशः -7.1, - 7 और -7। एपिकैटेचिन गैलेट Gln156 और Asp35 के साथ हाइड्रोजन बॉन्ड दिखाता है और फुल्विक एसिड Glu27 के साथ हाइड्रोजन बॉन्डिंग दिखाता है। सिंथेटिक यौगिकों के मामले में टाइडग्लुसिब ने एपोई4 के किसी भी एमिनो एसिड अवशेष के साथ हाइड्रोजन बॉन्डिंग नहीं दिखाई, लेकिन -7.2 की उच्च बंधन बंधुता दिखाई, जो प्राकृतिक यौगिक एस-एलिल-एल-सिस्टीन के समान है, जो -7.1 की उच्च बंधन बंधुता दिखाता है, लेकिन किसी भी एमिनो एसिड अवशेष के साथ हाइड्रोजन बॉन्डिंग नहीं दिखाता है। एपोई4 की प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रियाएं संबंधित प्रोटीन के साथ भौतिक और कार्यात्मक अंतःक्रिया दर्शाती हैं। हमारा अध्ययन संभावित प्रमुख यौगिक के रूप में एमिनो एसिड अवशेष के साथ बंधन बंधुता और हाइड्रोजन बॉन्डिंग के आधार पर एक यौगिक एपिकैटेचिन गैलेट की भविष्यवाणी करता है जिसका उपयोग अवरोधक के रूप में किया जा सकता है।
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