बायोमेडिसिन में अंतर्दृष्टि खुला एक्सेस

अमूर्त

मैट्रिक्स मेटालोप्रोटीनेज पर रुटिन का आणविक डॉकिंग अध्ययन

एस. गुरुदीबन

मैट्रिक्स मेटालोप्रोटीनेज (एमएमपी) जिसे मैट्रिक्सिन के नाम से भी जाना जाता है, घाव भरने, ऊतक इंजीनियरिंग और भ्रूणजनन में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। एमएमपी की क्रिया कई अंतर्जात ऊतक अवरोधकों द्वारा बाधित होती है लेकिन रोग संबंधी स्थिति के लिए प्राकृतिक या सिंथेटिक स्रोत से बहिर्जात अवरोधक की आवश्यकता होती है। इसलिए, वर्तमान अध्ययन का उद्देश्य मेटालोप्रोटीनेज पर रुटिन के निरोधात्मक प्रभाव का मूल्यांकन करना है। लक्ष्य प्रोटीन के सक्रिय स्थलों का अनुमान 3DLignadsite के माध्यम से लगाया गया था। लैमार्कियन आनुवंशिक एल्गोरिथ्म के आधार पर, ऊर्जा न्यूनतम रुटिन को ऑटोडॉक 4.2 का उपयोग करके MMP2, MMP3, MMP8 और MMP12 के साथ डॉक किया गया था। परिणाम बताते हैं कि रुटिन ने GLU पर MMP2 की -10.19kcalmol-1, LEU, THR पर MMP8 की -8.83kcalmol-1, ALA, HIS पर MMP3 की -8.83kcalmol-1 और CYS और HIS57 अवशेषों की -6.08kcalmol-1 के रूप में मुक्त ऊर्जा को बांधने के लिए प्रदर्शित किया। हम रुटिन को एक प्रभावी मैट्रिक्स मेटालोप्रोटीनेज अवरोधक के रूप में निष्कर्ष निकालते हैं। आगे के अध्ययन मैट्रिक्स मेटालोप्रोटीनेज अवरोधक के रूप में रुटिन के उपयोग की पुष्टि करेंगे।