पशु प्रजनन पशु विज्ञान की एक शाखा है जो पशुधन के आनुवंशिक मूल्य (अनुमानित प्रजनन मूल्य, ईबीवी) के मूल्यांकन (सर्वोत्तम रैखिक निष्पक्ष भविष्यवाणी और अन्य तरीकों का उपयोग करके) को संबोधित करती है। विकास दर, अंडा, मांस, दूध या ऊन उत्पादन में बेहतर ईबीवी या अन्य वांछनीय गुणों वाले जानवरों के प्रजनन के लिए चयन ने दुनिया भर में पशुधन उत्पादन में क्रांति ला दी है। पशु प्रजनन के वैज्ञानिक सिद्धांत में जनसंख्या आनुवंशिकी, मात्रात्मक आनुवंशिकी, सांख्यिकी और हाल ही में आणविक जीनोमिक्स शामिल हैं।