कैंसर स्टेम कोशिकाएँ कैंसर कोशिकाओं का एक उपसमूह हैं जो स्व-नवीकरण और बहु-वंश विभेदन की अपनी क्षमता के कारण कैंसर की जैविक आक्रामकता की भविष्यवाणी करने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं। सीएससी संभावित रूप से गहन नैदानिक महत्व के हैं। वे इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री का उपयोग करके ऊतक माइक्रोएरे में स्तन ट्यूमर के एक बड़े समूह की प्रोफाइलिंग करके स्तन सीएससी मार्करों की नैदानिक प्रासंगिकता स्थापित करते हैं।