संक्रमण की रोकथाम और नियंत्रण व्यवहार में सूक्ष्म जीव विज्ञान का नैदानिक अनुप्रयोग है। यह वायरस, बैक्टीरिया, कवक आदि के कारण हो सकता है। सभी स्वास्थ्य देखभाल सेटिंग्स में संचारी रोगों के संचरण को रोकने के लिए यह आवश्यक है। नियंत्रण टीम संक्रामक रोगों को रोकने और नियंत्रित करने के लिए रणनीतियों और कार्यक्रमों का विकास, कार्यान्वयन और मूल्यांकन करती है।