फार्माकोडायनामिक बायोमार्कर अपने लक्ष्य पर किसी दवा के फार्माकोलॉजिकल प्रभावों के बारे में जानकारी प्रदान कर सकते हैं। फार्माकोडायनामिक बायोमार्कर अध्ययन तंत्र के प्रमाण में अंतर्दृष्टि प्रदान कर सकता है (यानी, क्या एजेंट अपने इच्छित लक्ष्य को मारता है?) और अवधारणा का प्रमाण (यानी, क्या दवा लक्ष्य को मारने से वांछित जैविक प्रभाव होता है?)। फार्माकोडायनामिक बायोमार्कर अध्ययन किसी लक्षित एजेंट की इष्टतम बायोलॉजिक खुराक या शेड्यूलिंग के बारे में भी जानकारी प्रदान कर सकता है।
फार्माकोडायनामिक बायोमार्कर का उपयोग दवा आहार, लक्ष्य प्रभाव और जैविक ट्यूमर प्रतिक्रिया के बीच लिंक की जांच करने के लिए किया जा सकता है। केंद्रित पीडी बायोमार्कर माप के साथ नई दवा के विकास को युग्मित करना, लक्षित एजेंटों के तर्कसंगत संयोजनों का चयन करने और संयोजन दवा आहार के शेड्यूल को अनुकूलित करने के लिए, सूचित, जल्दी जाने/नहीं जाने वाले निर्णय लेने के लिए महत्वपूर्ण डेटा प्रदान करता है। पीडी एंडपॉइंट का उपयोग प्रीक्लिनिकल मॉडल में लीड यौगिकों के चयन से लेकर प्रथम-मानव परीक्षणों तक, दवा विकास के दौरान तर्कसंगतता और परिकल्पना-परीक्षण शक्ति को भी बढ़ाता है। लक्षित चिकित्सा प्रदान करने में इन महत्वपूर्ण भूमिकाओं को देखते हुए, दवा विकास में मान्य और विश्वसनीय नैदानिक पीडी परीक्षणों की शुरूआत आवश्यक है।