यह संगठन और उसके स्टाफ सदस्यों के बारे में सभी प्रासंगिक डेटा इकट्ठा करने की प्रक्रिया है। यह मुख्य रूप से एचआईवी और एड्स की विशेषताओं की पहचान करने पर ध्यान केंद्रित करता है। जोखिम विश्लेषण करके एचआईवी/एड्स के प्रति उनके जोखिम की पहचान करता है। जोखिम विश्लेषण संगठन स्तर पर खतरे, भेद्यता और क्षमता जैसे तीन चर निर्दिष्ट करके आयोजित किया जा सकता है। जोखिम विश्लेषण की गणना क्षमता से विभाजित खतरे और भेद्यता को गुणा करके की जा सकती है। एक संगठन अपनी भेद्यता को कम करके और अपनी क्षमता को बढ़ाकर अपने जोखिम को कम कर सकता है।