स्टेम सेल थेरेपी किसी बीमारी या स्थिति के इलाज या रोकथाम के लिए स्टेम सेल का उपयोग है। अस्थि मज्जा प्रत्यारोपण सबसे व्यापक रूप से इस्तेमाल की जाने वाली स्टेम सेल थेरेपी है। अस्थि-मज्जा का उपयोग ल्यूकेमिया और लिम्फोमा जैसी स्थितियों वाले कैंसर रोगियों के इलाज के लिए किया गया है। स्टेम सेल उपचार प्रोटोकॉल बीमारियों के इलाज के लिए एलोजेनिक मानव गर्भनाल स्टेम कोशिकाओं, ऑटोलॉगस अस्थि मज्जा स्टेम कोशिकाओं और ऑटोलॉगस वसा स्टेम कोशिकाओं के अच्छी तरह से लक्षित संयोजनों का उपयोग करते हैं।